Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Antibiotic Susceptibility and Capsular Genes of Streptococcus pneumoniae Colonizing Children with chronic Respiratory Diseases/
المؤلف
Abdallah,Fatma Elzahraa Hamdi
هيئة الاعداد
باحث / فاطمه الزهراء حمدي عبدالله
مشرف / مها محمد فتحي
مشرف / إيمان محمود فوده
مشرف / نيرمين محمود أحمد
مشرف / هبة مصطفى حمزة فهمي
تاريخ النشر
2021
عدد الصفحات
137 p:
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
ماجستير
التخصص
علم الأحياء الدقيقة (الطبية)
تاريخ الإجازة
1/1/2021
مكان الإجازة
جامعة عين شمس - كلية الطب - الميكروبيولوجيا الطبية والمناعة
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 136

from 136

Abstract

تعد المكورات العقدية الرئوية المستعمرة للجهاز التنفسي أحد المسببات الرئيسية لتفاقم العدوى الحادة في الأطفال المصابين بأمراض الرئة المزمنة. ومن ثم فان تحديد النمط المحلي لحساسية المكورات العقدية الرئوية للمضادات الحيوية في هؤلاء المرضى أمر بالغ الأهمية للعلاج الاسترشادي. علاوة على ذلك، فانه من المهم تحديد أنماط السلالات السائدة لتقييم فعالية اللقاحات المتاحة.
كان الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو الكشف عن نمط الحساسية للمضادات الحيوية والبحث عن جينات بعض أنواع الغشاء في المكورات العقدية الرئوية المستعمرة للجهاز التنفسي للأطفال المصابين بأمراض الرئة المزمنة.
أجريت هذه الدراسة خلال الفترة من سبتمبر 2019 حتى فبراير 2020 على احدى وخمسون طفلاً تزيد أعمارهم عن عامين ويعانون من أمراض رئوية مزمنة مثل توسع القصبات التليفى الكيسي ، وتوسع القصبات التليفي غيرالكيسي ، ومرض الرئة الخلالي.
كان الاطفال يرتادون عيادة الصدر في مستشفى الأطفال بجامعة عين شمس للتقييم السريري والمتابعة وقد خضعوا لتنظير القصبات لأسباب سريرية مختلفة.
تم استبعاد الأطفال الذين يعانون من تفاقم حاد مشتبه به أو مؤكد للعدوى و / أو الذين تلقوا مضادات الميكروبات في الثلاثين يومًا السابقة لتجميع العينات. ولم يتلق أي من المرضى المسجلين في الدراسة لقاح المكورات العقدية الرئوية.
تم جمع عينات غسيل القصبات الهوائية من جميع المرضى ونقلها على الفور إلى مختبر الميكروبيولوجيا الطبية التابع لقسم الميكروبيولوجيا الطبية والمناعة بكلية الطب جامعة عين شمس.
تم زرع العينات على وسائط أجار كولومبيا المدعمة بنسبة 5 ٪ بدم الحصان، وتم وضعها في الحضانة طوال الليل عند درجة 37 مئوية في بيئة غنية بثاني أكسيد الكربون. تم التعرف على المستعمرات المشتبه بها من خلال الشكل الظاهري، والفحص المجهري بصبغة بالجرام ، والنتيجة السلبية لتفاعل الكاتلاز ، والحساسية لمضاد الاوبتوكين.
وقد تم تحديد الحساسية للمضادات االحيوية للعزلات المكورات العقدية الرئوية باستخدام طريقة الانتشار القرصي وفقًا لإرشادات معهد المعايير السريرية والمخبرية لعام 2019.
تم إجراء تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل المتعدد للبحث عن بعض أنواع جينات الغشاء للمكورات العقدية الرئوية [3 / f / (22A) / 19A / 6A / 6B / 4/14 / 12F / (12A) / 9V / (9A)22] ، في تفاعلين متتابعين.
شملت الدراسة ثلاثين (58.9٪) من الإناث و واحد وعشرين (41.1٪) من الذكور. تراوحت أعمارهم بين 3 إلى 12 سنة، بمتوسط ± وانحراف معياري 6.47 ± 2.69. كان ثمانية وعشرون طفلا بنسبة (54.9٪) في سن ما قبل المدرسة (5-3 سنوات). وكان توسع القصبات هو مرض الرئة الغالب للأطفال المسجلين في الدراسة (42 من 51 ؛ 82.3٪) بما في ذلك توسع القصبات التليف الكيسي في 22 من أصل 51 (43.1٪) وتوسع القصبات غير الكيسي في 20 (39.2٪) ). وكان مرض الرئة الخلالية هو المرض الأساسي في 9 من أصل 51 حالة (17.7٪).
تم عزل 32 (62.75٪) من سلالات المكورات العقدية الرئوية. وعليه فقد تم تصنيف الأطفال المشمولين إلى مجموعتين: المجموعة المستعمرة 32 من 51 (62.75٪) ، والمجموعة غير المستعمرة 19 (37.25٪).
لم يتم العثور على فرق معتد به إحصائياً بين مجموعتي المستعمرين وغير المستعمرين فيما يتعلق بالجنس أو متوسط العمر أو الحالة العمرية الدراسية. حوالي ثلثي الأطفال المصابين بتوسع القصبات (28/42 ؛ 66.6٪) كانوا مستعمرين بالمكورات العقدية الرئوية و 4 (44.5٪) من تسعة مرضى مصابين بأمراض الرئة الخلالية كانوا مستعمرين بالمكورات العقدية الرئوية. لم يتم العثور على ارتباط ذي دلالة إحصائية بين استعمار العقدية الرئوية وأي من أمراض الرئة الموجودة مسبقًا.
كانت جميع العزلات حساسة للفانكومايسين (100٪) ، وكانت أقل معدلات المقاومة للليفوفلوكساسين (6.3٪) واللينزوليد (9.4٪) ، بينما كانت أعلى معدلات المقاومة للكليندامايسين (71.9٪) والإريثروميسين(68.8٪).
أظهرت دراسة النوع الجيني لغشاء السلالات المعزولة أن 21 (" ~ " 66٪) من العزلات كانت من النوع 6A 6B وأن 8 (25٪) من العزلات تحتوي على النوع 14 من جينات الغشاء. ولم يكن نوع جين الغشاء في ثلاث سلالات (" ~ " 9٪) من الأنواع الثمانية الرئيسية التي تم البحث عنها بواسطة تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل المستخدمة. وقد أظهرت النتائج أن 75٪ من المرضى المستعمرين بعزلات تحتوي على جين من نوع الغشاء 14، يعانون من توسع القصبات كمرض رئوي مزمن ، وكان لهذه النتيجة دلالة إحصائية (P <0.05).
بدراسة توزيع أنماط الحساسية لمضادات الميكروبات في العزلات ذات الأنواع المختلفة من جينات الغشاء، لم يتم الكشف عن فروق ذات دلالة إحصائية.وكانت معظم السلالات الحاملة للجينات من النوع 6A / 6B و 14 حساسة للليفوفلوكساسين (90.5٪ و 87.5٪ على التوالي) واللينزوليد (90.5٪ و 100٪ على التوالي). تم الكشف عن معدلات عالية من عدم الحساسية للإريثروميسين والكليندامايسين في عزلات كلا النوعين. وكان لما يقرب من 50٪ من العزلات أنماط عدم حساسية متعددة لمضادات الميكروبات المختلفة (أكثر من ثلاثة مضادات للميكروبات).
الاستنتاجات:
Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) is a main pathogen causing acute infectious exacerbations in chronic lung diseases (CLD) children. Determining the local antibiotic susceptibility pattern of colonizing strains in these patients is crucial for empirical therapy. Moreover, identifying prevalent types is important to evaluate the effectiveness of available vaccines. This study aimed to detect antibiotic susceptibility and searching for some capsular gene types among S. pneumoniae isolates colonizing respiratory tract in CLD children. Methods: Bronchoalveolar lavage (BAL) samples were collected from 51 CLD children undergoing bronchoscopy in Ain Shams University Pediatric Hospital. All identified S. pneumoniae isolates were tested for antibiotic susceptibility. Two-steps sequential multiplex PCR technique was performed to detect capsular gene types: [3/ 22f/(22A) / 19A / 6A/6B /4 / 14/ 12F/(12A) / 9V/(9A). Results: from 51 BAL samples, 32 (62.75%) pneumococcal strains were isolated. Most of the isolates had capsular gene type 6A/6B (65.6%). Capsular gene type 14 was detected in 25% of isolates. In 9.4% of strains, capsular type could not be identified. All isolates were sensitive to vancomycin. The lowest resistance rate was to levofloxacin (6.3%) and linezolid (9.4%), while the highest rates were to clindamycin (71.9%) and erythromycin (68.8%). Conclusion: Streptococcus pneumoniae colonizing CLD children showed high resistance to clindamycin and erythromycin thus highlighting the importance of antimicrobial stewardship programs in all levels of healthcare. Capsular gene type 6A/6B was the commonest colonizing type suggesting that CLD children can benefit from the currently available PCV13 vaccine.