Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
molecular characterization of plasmid mediated carbapenem resistance of some gram negative uropathogens /
الناشر
ANN AYMAN IBRAHIM ELSAYED IBRAHIM ELSHAMY
المؤلف
elshamy, ann ayman ibrahim elsayed ibrahim
هيئة الاعداد
باحث / آن ايمن ابراهيم السيد ابراهيم الشامي
مشرف / نادية عبد الحليم حسونة
مشرف / محمد مبروك أبوالوفا
مشرف / خالد محمد أنور أبوشنب/ سارة ابراهيم صالح ضيف
تاريخ النشر
2023
عدد الصفحات
182P:
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
العلوم الصيدلية
تاريخ الإجازة
16/2/2023
مكان الإجازة
جامعة عين شمس - كلية الصيدلة - ميكروبيولوجي ومناعة
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 210

from 210

Abstract

المستخلص العربي
تعد البكتيريا سالبة الجرام من أكثر المسببات الشائعة لعدوى مجرى البول. كما أنها قادرة على اكتساب الجينات التي تمنحها آليات مقاومة للمضادات الحيوية، بما في ذلك مجموعة الكربابينيم. لذلك، هدفت هذه الدراسة إلى الكشف عن معدل انتشار جينات الكربابينيماز الموجودة في بلازميدات البكتيريا سالبة الجرام المسببة لعدوى مجرى البول ومحاولة التغلب على مقاومة الكربابينيم في بعض العزلات.
تم إجراء اختبار الحساسية لمضادات الميكروبات والكشف عن إنتاج انزيمات الكربابينيماز في العزلات التي تم تجميعها، ثم الكشف عن جينات الكربابينيماز الموجودة على البلازميدات. كما خضعت البلازميدات التي تحتوي على جينات الكربابينيماز في هذه الدراسة لعملية النقل البلازميدي إلى سلالة الاشيريشيا كولاي (E. coli DH5α). تم استخراج البلازميدات من احدى البكتيريا المكتسبة لها لتوصيف البلازميدات المنقولة. بالإضافة إلى ذلك، تم دراسة تأثير دمج الميروبينيم مع مضادات ميكروبات أخرى (أميكاسين، كوليستين، تيجيسيكلين) على بعض العزلات المقاومة للكاربابينيم. كما تم عزل عاثيات قادرة على غزو البكتيريا سالبة الجرام المقاومة للكاربابينيم من مياه الصرف الصحي بمستشفى الدمرداش وتم تمييزها ظاهرياً ودمج كل منهن مع الميروبينيم للكشف عن تأثير دمج العاثيات مع الميروبينيم على العزلات المختبرة.
تم تجميع 256 عزلة بكتيرية إكلينيكية سالبة الجرام في هذه الدراسة، منها 65 عزلة (25.4٪) مقاومة للكربابينيم، ومن بينهم 36 عزلة (٪55.4) كانت منتجة لانزيمات الكربابينيماز، واحتوت 31 عزلة (٪47.7) على بلازميدات. تم استخلاص البلازميدات من العزلات واستخدامها في تفاعل البلمرة المتسلسل للكشف عن جينات الكربابينيماز blaOXA-48، blaKPC، blaVIM، blaNDM، .blaIMPحملت 24 عزلة (٪77.4) من العزلات المختبرة جين الأوكساسيليناز blaOXA-48، بينما وُجد جين blaVIM في 8 عزلات (٪25.8) فقط، ووُجدت جينات blaNDM و blaKPC في عزلة واحدة (٪3.2). نجحت عملية نقل البلازميدات من 5 عزلات من الكليبسيلا الرئوية (K. pneumoniae)وعزلتين اشيريشيا كولاي (E. coli) إلى سلالة الاشيريشيا كولاي ((E. coli DH5α والتي اكتسبت مقاومة لبعض مضادات الميكروبات إلى جانب القدرة على إنتاج انزيمات الكربابينيماز. كان طول التسلسل النهائي للبلازميد المختبَر 46.160 زوج قاعدي مع محتوى GC بنسبة 46.28٪ واحتوى على 58 إطار قراءة مفتوح. ينتمي البلازميد إلى مجموعة عدم توافق البلازميد IncX3 ويحمل 3 جينات مقاومة وهي blaNDM-1،bleMBL ، و aph (3 ’) – VI. أظهرت نتائج دمج الميروبينيم مع مضادات الميكروبات الأخرى (الميروبينيم مع الأميكاسين، والميروبينيم مع الكوليستين، والميروبينيم مع التيجيسيكلين) تأثيراً إضافياً أو غير مؤثر على نشاط الميروبينيم لجميع العزلات المختبرة باستثناء عزلة واحدة ((K. terrigena، حيث لوحظ تأثيراً متآزراً عند دمج الميروبينيم مع أميكاسين بتركيزات 4 و8 ميكروغرام/مل. تم عزل أربع عاثيات قادرة على غزو بكتيريا اسينتوباكتر بوماني(A. baumannii) من مياه الصرف الصحي بمستشفى الدمرداش وتم تمييزهن ظاهرياً. أظهرت نتائج دمج العاثيات مع الميروبينيم تأثيرات غير مؤثرة على العزلات المختبرة. خلصت الدراسة إلى أن معدل مقاومة الكربابينيم بين البكتيريا سالبة الجرام المسببة لعدوى مجرى البول مرتفع نسبياً، ويمكن أن تنتقل هذه المقاومة أفقياً بين العوائل البكتيرية. ولا يزال كوليستين وتيجيسيكلين فعالين لعلاج العدوى المقاومة للكربابينيم. كما يمكن استخدام العاثيات في علاج العدوى المقاومة للكربابينيم بناءً على البيانات الأولية في المختبر.


الملخص العربي
تعتبر البكتيريا سالبة الجرام من أهم المسببات الشائعة لعدوى مجرى البول، ومعظمها مقاوم لمضادات الميكروبات بما في ذلك مجموعة الكربابينيم؛ والتي تعتبر خط الدفاع الأخير المستخدم لعلاج العدوى ذات المقاومة المتعددة لمضادات الميكروبات. لذلك، شملت أغراض هذه الدراسة الكشف عن معدل مقاومة الكربابينيم وإنتاج انزيمات الكربابينيماز بين العزلات البكتيرية سالبة الجرام المستخرجة من عينات بول المرضى المصابين بعدوى مجرى البول. كما تناولت الدراسة الكشف عن انتشار جينات الكربابينيماز المنقولة بالبلازميدات، واستكشاف إمكانية نقل هذه الجينات أفقياً إلى عوائل بكتيرية أخرى، إلى جانب محاولة التغلب على مقاومة الكربابينيم في بعض العزلات التي تم تجميعها.
في هذه الدراسة، تم تجميع 256 عزلة بكتيرية إكلينيكية سالبة الجرام، وتم تعريف 210 (82٪) منهم على أنها بكتيريا قولونية (Enterobacteriaceae)، 31 (12٪) عزلة سودوموناس (Pseudomonas spp.)، و15 (٪6) عزلة كانت من نوع اسينتوباكتر (.Acinetobacter spp)، ومن بين العزلات التي تم تجميعها، كانت 65 عزلة (٪25.4) مقاومة للكربابينيم، و36 منها (٪55.4) كانت منتجة لإنزيم الكربابينيماز.
والجدير بالذكر أنه من بين 65 عزلة مقاومة للكربابينيم، احتوت 31 (٪47.7) عزلة على بلازميدات. وأظهرت نتائج تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) وجود جين الأوكساسيليناز blaOXA-48 في بلازميدات 24/31 (٪77.4) من العزلات المختبرة، بينما تم الكشف عن جين blaVIM في 8/31 (٪25.8) من العزلات. تم الكشف أيضاً عن كلا من الجينات blaKPC وblaNDM في عزلة واحدة (٪3.2) من 31 عزلة، ولم يتم الكشف عن جين blaIMP في أي من مستخلصات البلازميدات.
علاوة على ذلك، خضعت البلازميدات التي تحتوي على جينات الكربابينيماز في هذه الدراسة لعملية النقل البلازميدي إلى سلالة الاشيريشيا كولاي (E. coli DH5α) لمقارنة الخصائص المظهرية للبكتيريا المكتسبة للبلازميدات مع تلك الخصائص في العزلات السريرية الأم. تم استخلاص البلازميدات التي تم نقلها بنجاح في الدراسة الحالية من 5 عزلات من الكليبسيلا الرئوية K. pneumoniae)) وعزلتين اشيريشيا كولاي ((E. coli. أظهر اختبار الحساسية لمضادات الميكروبات أن البكتيريا المكتسبة لهذه البلازميدات اكتسبت خصائص مقاومة جديدة لمضادات الميكروبات مقارنة بالعزلات الإكلينيكية الأصلية، كما أن جميعها أظهرت القدرة على انتاج الكربابينيماز. تم استخراج البلازميدات من البكتيريا المكتسبة لها (ن = 7) واستخدمت في تفاعل البلمرة المتسلسل لتأكيد وجود جينات الكربابينيماز في البكتيريا المكتسبة للبلازميدات، وكذلك للكشف عن وجود جينات مقاومة لمضادات ميكروبات أخرى بما في ذلك جينات البيتالاكتماز واسعة المدى (ESBL) (مثلblaSHV ، blaCTX-M ، وblaTEM )، بالإضافة إلى جين aac (6 ’) - Ib الذي يمنح مقاومة لمجموعة الأمينوغليكوزيدات. أكدت نتائج تفاعل البلمرة المتسلسل أن جميع البكتيريا المكتسبة للبلازميدات كانت تحمل جين blaOXA-48، 2 منها حملتا جينblaVIM ، 1 حملت جينblaNDM ، 3 حملن جين blaCTX-M ، 1 حملت جينblaTEM ، 2 حملتا جين aac (6 ’) - Ib و 2 حملتا جين blaSHV.
تم استخراج البلازميدات من احدى البكتيريا المكتسبة لها لتحديد التتابع النيوكلوتيدي بها. كان طول التسلسل النهائي 46.160 زوج قاعدي مع محتوى GC بنسبة 46.28٪ و58 إطار قراءة مفتوح. ينتمي البلازميد إلى مجموعة عدم توافق البلازميد IncX3 ويحمل 3 جينات مقاومة وهي blaNDM-1،bleMBL ، و aph (3 ’) – VI.
تم اختيار 19 عزلة لدراسة تأثير دمج الميروبينيم مع مضادات ميكروبات أخرى (أميكاسين، كوليستين، تيجيسيكلين) كمحاولة للتغلب على مقاومة الكربابينيم أو تقليلها في هذه العزلات. أظهرت النتائج تأثيراً إضافياً أو غير مؤثر على نشاط الميروبينيم لجميع العزلات المختبرة باستثناء عزلة واحدة ((K. terrigena، حيث لوحظ تأثيراً متآزراً عند دمج الميروبينيم مع أميكاسين بتركيزات 4 و8 ميكروغرام/مل.
تم عزل أربع عاثيات قادرة على غزو بكتيريا اسينتوباكتر بوماني(A. baumannii) المقاومة للكربابينيم من مياه الصرف الصحي بمستشفى الدمرداش وتم تمييزها ظاهرياً. تم دمج كل منهم مع الميروبينيم للكشف عن تأثير دمج العاثيات مع الميروبينيم على العزلات المختبرة. أظهرت النتائج تأثيرات غير مؤثرة مع جميع العاثيات.
خلصت الدراسة إلى أن معدل مقاومة الكربابينيم بين البكتيريا سالبة الجرام المسببة لعدوى مجرى البول مرتفع نسبياً، ويمكن أن تنتقل هذه المقاومة أفقياً بين العوائل البكتيرية. ولا يزال كوليستين وتيجيسيكلين فعالين لعلاج العدوى المقاومة للكربابينيم. كما يمكن استخدام العاثيات في علاج العدوى المقاومة للكربابينيم بناءً على البيانات الأولية في المختبر.